Snakemake auf Cluster unterschiedliche Arten ⇐ Python

[Anonymous]

Wenn Sie Snakemake auf einem Cluster ausführen, und wenn wir keine spezifischen Anforderungen für einige Regeln für die Anzahl von Kernen/Speicher haben, was ist der Unterschied zwischen:

• Verwenden des klassischen Weges, d. H. Regel)
• Verwenden von Snakemake wie ein normales Tool und rufen Sie es mit Srun in einem Sbatch-Skript auf, ohne es zu sagen, dass dies eine Slurm-Umgebung ist (1 Job = Ganze Pipeline)

Beispiel der zweiten Option: