Legen Sie den Speicherort des .snakemake-Verzeichnisses festPython

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Anonymous
 Legen Sie den Speicherort des .snakemake-Verzeichnisses fest

Post by Anonymous »

Gibt es eine Möglichkeit zu definieren, wo Snakemake den Ordner .snakemake erstellt?
Ich könnte das gesamte Arbeitsverzeichnis mit --directory ändern, dies ändert jedoch auch den Speicherort jedes relativen Pfads.
Ich dachte, --shadow-prefix wäre das, was ich mir erhofft hatte, aber .snakemake/scripts wird beispielsweise immer noch im Arbeitsverzeichnis erstellt.
Der Grund dafür ist, dass ich auf einem gemeinsam genutzten CIFS/SMB-Laufwerk arbeite (über das ich keine Kontrolle habe). Theoretisch habe ich Lese-/Schreibzugriff, aber für einige Aktionen, die Snakemake im .snakefile-Ordner ausführt, verweigert es die Erlaubnis (ich weiß nicht warum). Ich hoffe also, dass ich .snakemake auf einem kleinen lokalen Laufwerk platzieren kann, die Daten des Workflows aber weiterhin auf das CIFS/SMB geschrieben werden.

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